לצד אלה, נצפות בשנים האחרונות כמה תעלומות מטרידות שעדיין לא נמצא להן הסבר מְסַפֵּק, וחלקן קשורות לשאלה "ממה בכלל מורכב היקום שלנו". למשל, כשמסתכלים על ההתנהגות של הכוכבים והגלקסיות מבחינים בתופעה מוזרה. המהירויות של רבים מהם כלל אינן תואמות לצפי של המשוואות שלנו, בעיקר של משוואות הגרביטציה. האם זה אומר שהמשוואות שגויות? ייתכן, אבל קיימת גם אפשרות נוספת. מרכיב חשוב בחישוב הגרביטציה הוא המסה של הגופים המושכים זה את זה – ככל שהמסה גדולה יותר, כך גדל גם כוח הכובד. האם קיימת אפשרות שהפערים נובעים מכך שמסתתר שם חומר שנעלם מאתנו שאותו לא הכנסנו לחישובים, ושבגללו כוחות הכובד הפועלים ביקום הם גדולים בהרבה ממה שהחישובים שלנו מראים?